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Teaching

    Lecture Content

  • Biological Physics 1 (Physics degree - Level I - Laurea in Fisica) 2018-2019 (in English) (in Italian)

  • Biological Physics 2 (Physics degree - Level II - Laurea in Fisica) 2018-2019 (in English) (in Italian)

  • Measurement and analysis of biosignals (in English) (in Italian)

  • Theory and computaional methods for biological physics (in English) (in Italian)

  • Lecture Notes

  • Fisica_Biologica_1 (2017-2018) [79.7 MB]

  • Fisica_Biologica_2 (2017-2018) [46.4 MB]
  • Past and more recent PhD thesis `
  • Emiliano De Santis: From molecules, to aggregates. A synergic experimental and computational approach (2019)
  • Francesco Stellato: X-ray Absorption Spectroscopy: a powerful tool for structural studies of molecules involved in the pathogenesis of neurodegenerative diseases (2010)
  • Francesco Guerrieri: Computer simulations of biomolecules: the case of the N-terminal PrP Cu binding site. (2008)
  • Velia Minicozzi: Modeling biological systems by computer simulations: the case of biological membranes. (2001)
  • Antonella Longo: XAS study of the reconstitution process of Cu,Zn superoxide dismutase in the presence of Cu(I)-GSH complex (1991)
  • Mariangela Freda: The reverse micelles as a model to study hydration phenomena: Molecular Dynamics simulations and experiments. (1998-1999)
  • Past Master Thesis

  • Antonio Vitale: Aggregazione e inibizione dell'aggregazione di molecule di insulina: uno studio dinamica molecolare (2015-2016)
  • Simone Aureli: Progettazione di un peptide in grado di favorire l'aggregazione di idrocarburi. Uno studio di dinamica molecolare classica. (2014-2015)
  • Zelio Fusco: The effect of Beta-sheet breaker peptides and metal ions on Amyloid beta1-40 peptide fibrillazation process (2015)   PDF
  • Emilia Capozzi: Molecular Dynamics study of the interaction between model membrane and a new anticancer-radiopeptide (2015)
  • Emiliano De Santis: Il legame degli ioni Cu(II) e Zn(II) con il peptide β-amiloide. Uno studio con spettroscopia di assorbimento dei raggi X (2013-2014)   PDF
  • Claudia Narcisi: I Beta Sheet Breakers come Inibitori della Formazione di Fibrille Amiloidi: Studi Computazionali e Verifiche Sperimentali (2014)  
  • Marco Pascucci: Cu(II) and Zn(II) cross modulation in prion protein binding (2012)
  • Andrea Coletta: Uno Studio con metodologie "ab-initio" di un farmaco antitumorale appartenente alla famiglia delle camptotecine (2008)
  • Stefania Alleva: Frequenza di occorrenza del tetrapeptide HGGG e sue possibili implicazioni biologiche (2007)
  • Francesco Stellato: Il Ruolo dei Metalli nei Processi di Aggregazione: uno Studio con Spettroscopia a Raggi X (2006)
  • Valentina Balzarotti: Algoritmi per il riconoscimento di regolarit à nella sequenza amminoacidica. Applicazioni per la comprensione dei meccanismi immunologici (1990)
  • Antonella Longo: Indagine strutturale del sito attivo della superossido dismutasi bovina: analisi dello spettro EXAFS del rame nell'enzima ossidato, ridotto ed in presenza dell'anione cloruro.
  • Velia Minicozzi : Il Mimetismo Molecolare: Analisi Statistica ed Implicazioni Evolutive. (1994-1995)
  • Sara Letardi: Doppi strati lipidici e membrane biologiche: uno studio di Dinamica Molecolare (1997-1998)
  • Filippo Ciferri: Algoritmi di minimizzazione globale: applicazioni alle macromolecole biologiche (1992-1993)
  • Sonia Mele: Caratterizzazione structturale del dominio SAM della proteina p63 mediante spettroscopia NMR
  • Francesco Marcocci: Misure di residual dipolar couplings della proteina MIc1p
  • Luca Fiaschi: Clarifying the gene expression in high eukaryotes using stochastic dynamics. (2009-2010)
  • Past Bachelor Thesis

  • Nicole Luchetti: Protein folding and protein aggregation: the case of natively unfolded protein. (2017-2018)
  • Giulia Romoli: Protein folding and protein aggregation: the case of natively unfolded protein(2015-2016)
  • Stefano Campagnaro: Il misfolding delle proteine nella scienza alimentare(2013-2016)
  • Emiliano De Santis: Il misfolding proteico e la sclerosi laterale amiotropica(2010-2011)
  • Michela Marconi: Il ruolo fisiologico della taurina e la sua interazione con le protein amiloidogeniche (2010-2011)
  • Erika Brugnoli: Lo “splicing” alternativo: implicazioni diagnostiche(2009-2010)
  • Claudia Narcisi: Reversibilità della transizione conformazionale dell Aβ peptide: evidenze sperimentali e simulazioni numeriche
  • Simona Dalla Bernardina: Produzione di idrogeno mediante fotosintesi clorofilliana (2008-2009)
  • Stefania Alleva: Frequenza di occorrenza del tetrapeptide HGGG nelle proteine umane e sue possibili implicazioni biologiche (2005-2006)